قوم الصندوق العربي، كل عام، بتوجيه حوالي 5% من أرباحه من العمليات إلى المعونات. تهدف المعونات إلى توفير الدعم المؤسسي للدول الأعضاء، وزيادة كفاءة تنفيذ المشاريع، بالإضافة إلى إجراء الدراسات الفنية والاقتصادية فيما يخص مجالات التنمية. يتراوح مبلغ المعونة ما بين 25 ألف د.ك. و 300 ألف د.ك.، وتتم الموافقة عليها من جانب مجلس إدارة الصندوق، وتصبح نافذة بعد توقيعها من جانب كل من الصندوق العربي والجهة المستفيدة وفق “خطاب تفاهم” يوضح إجراءات تنفيذ المعونة وأسلوب السحب منها.

وفي إطار دعم صمود الشعب الفلسطيني، من أجل مساندة جهوده للمقاومة والتمسك بالأرض وتحسين ظروفه الاقتصادية والاجتماعية، يخصص الصندوق العربي10% من صافي أرباحه، كل عام بدءاً من عام 2001، لتمويل البرنامج العاجل لدعم الشعب الفلسطيني، والذي يشتمل على دعم المؤسسات والجمعيات الأهلية غير الحكومية التي تقوم بتقديم الخدمات التعليمية والصحية والاجتماعية للمجتمعات المحلية، ودعم الجامعات والمؤسسات التعليمية، وإنشاء المباني الجامعية، وتطوير الموارد البشرية، وتعزيز خدمات الرعاية الصحية، والتجاوب مع متطلبات التنمية الريفية والتمكين الاقتصادي